秦朝灭亡时秦军的主力在哪里

秦军主力在巨鹿之战中被项羽歼灭。

秦末大起义中，项羽率领数万楚军，同章邯和王离所率四十万秦军主力在巨鹿进行的一场重大决战性战役，项羽破釜沉舟，猛攻秦军，最终全歼王离率领的秦军，并于八个月后迫使另二十万章邯秦军投降，经此一战，秦朝主力尽丧，名存实亡。