单位有权扣留执业医师资格证书吗

根据相关法律法规，用人单位不得扣押医师资格证书等证件原件。

作为证明医生行医技能和行医资格的两证，本来就应该属于医生本人保管。也许医院管理者是出于保护本院人才，限制人员流动的目的而试图替医生保管两，但医疗机构要认真学习劳动、人事等相关法律法规，在法律允许的框架内制定人事或劳动合同，合法合理维护医疗机构的权益。